为这里和世界各地的超级计算资源提供优先访问权

科技新闻 2020-05-23 15:15113

今朝全球科学界正在联手,为相识、追踪、预测、测试和找到治愈当前冠状病毒大风行的要领,作出了前所未有的尽力。但在危机中,每一秒的损失都意味着更多的生命损失,光靠连合是不足的。超等计较机使科学家举办研究、收集和阐明数据的速度大大加速。在这场COVID-19大风行期间,它们从未向社会证明过本身的代价。

为这里和世界各地的超等计较资源提供优先会见权

超等计较机为正在研究COVID-19的科学家提供了奇特的本领:他们可以在分子程度上摸索病毒的布局和行为,同时设计药物和预测疾病的流传速度比其他要领要快得多。

德克萨斯州高级计较中心(TACC)于2020年2月开始响应计较时间请求,协助冲击COVID-19。本年3月,白宫通过COVID-19高机能计较(HPC)财团(COVID-19 High-Performance Computing,HPC)招募了一些世界上最强大的超等计较机,这是一个公私相助同伴干系,为全世界的研究人员提供了大量的计较资源。

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作为这项事情的一部门,他们正在与团队密合适作,为这里和世界各地的超等计较资源提供优先会见权。在许多公司仅此一项,就有100多个项目,涉及数千名研究人员,利用HPC系统来预测家庭订单和学校停课等过问法子的结果;模仿使病毒具有毒性的卵白质的分子行为;相识病毒的遗传学及其易变性;筛选潜在药物和疫苗的有效性,可视化并与决定者交互共享数据。

在TACC,近三分之一的计较时间都在致力于加快这些尽力,相当于40000台台式计较机不断地运算。假如没有美国国度科学基金会(NSF)和能源部(DOE)为高机能计较提供的联邦资金,这一切都不行能实现。40多年来,美国国度科学基金会(NSF)和能源部一直将开放会见超等计较机作为其任务的一部门。

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除了大型呆板之外,超等计较中心还雇佣了一些计较科学规模最智慧的人,这些人正与全球各地的团队相助,快速举办研究。

这些相助同伴包罗德克萨斯大学奥斯汀分校COVID-19建模同盟,该同盟由劳伦·安塞尔·迈耶斯博士率领,开拓了基于病毒流传和及时手机数据的疾病流传的领先风行病学模子之一。白宫和疾控中心,以及全国媒体和公家,都操作这一模式来奉告他们的领略和决定。

美国能源部阿贡(Argonne)和布鲁克海文国度尝试室(Brookhaven National Laboratories)的一个团队应用了世界上几台最强大的超等计较机,加快了基于人工智能的药物对接要领。他们的尽力将60亿个大概的小分子缩小到了30个,最大的大概是与病毒的一种卵白质结归并粉碎其成果。这些正在芝加哥大学的尝试室举办测试。

以TACC为动力的COVID-19药物发明连系会正在与世界上最大的筛选化合物供给商Enamine、德克萨斯A&M波士顿大学和德克萨斯大学医学分支机构相助,以确定最有但愿、最容易得到的600种药物,类药物分子2.6条并在高度关闭的尝试室举办测试,以便在数月而不是数年内找到潜在的药物。新项目天天都在启动。

在这些案例中,恒久的研究相助有助于加速项目标实施。UT奥斯汀建模同盟的预测成立在梅耶斯团队对流感大风行建模的十年联邦扶助研发的基本上。美国能源部的研究人员回收了基于人工智能的SARS-CoV-2癌症药物发明要领。药物发明协会操作多年来开拓的东西和要领冲击生物可怕主义。这些团队的一连干系使他们可以或许在致力于配合好处的进程中转移他们的研究重点,扩大他们的范畴,淘汰限制。

学术研究往往是一个漫长进程中的第一步,这需要当局机构、慈善组织和家产界的尽力。基本科学辅佐决定者掩护公众,并为疫苗和治疗的发现提供信息。

在正常环境下,这个进程需要数年或数十年。然而,时间是人们基础没有的奢侈品。对面对的挑战的紧要性使得像超等计较机这样的研究加快器的应用对付辅佐平缓曲线、最终办理这个社会所面对的最大危机越发要害。

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美国约翰斯·霍普金斯大学17日宣布的新冠疫情最新统计数据显示,全球累计确诊病例高出470万例。全球疫情不确定性加强的本日,需要全球科学家共同尽力。

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